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MD計算機の決定版!!Amber、GromacsをGPUにて高速計算！
NVIDIA最新GPU TeslaC2075搭載のMD計算用計算機。
NVIDIA最新GPU TeslaC2075搭載のMD計算用計算機。
MD5600R-3.06-96GB
標準構成
| CPU | Intel Xeon X5675（3.06GHｚ 6core）X2 |
|---|---|
| Chipset | Intel 5520 |
| Memory | DDR3-1333 8GB x 12 (Total 96GB) |
| GPU | Quadro600（画面表示用） NVDIA TeslaC2075（計算専用） |
| HDD | SATA 1TB |
| 光学ドライブ | DVDスーパーマルチ |
| ネットワーク | 2ポート |
| Case | FullTower （EIA規格19インチラックマウント可能） |
| その他付属品 | キーボード マウスセット LANケーブル |
プリインストール
| ■OS | CentOS5.6 |
| ■分子動力学計算ソフト | Amber、Gromacsプリインストール（※1） |
| ■並列環境 | OpenMPI、MPICH1、MPICH2 |
| ■CUDA環境 | CUDA4.0 |
| ■JOB管理ソフト | LAVA(※)、NIS、NFS、ネットワーク設定 |
| ■可視化ソフト | VMD |
※LAVAはTeslaに対するJOB管理には対応しておりません。
特徴
カリフォルニア大学が開発した、分子動力学計算ソフトAmber11とフローニンゲン大学で開発されたGromacsをプリインストール(※)NvidiaTeslaC2075にてAmber、APCを高速計算可能。また、分子動力学計算用可視化ソフト(VMD)も標準搭載しており、計算から可視化まで納入されたその日から始めることが可能です。 ※Amber11のライセンスを所有されていることが条件となります。
Amber11によるベンチマーク結果
爆発研究所では、AMBER付属のベンチマークデータをCPU（最大8core並列）で実行した場合と、GPU(TeslaC2050)で実行した場合を比較しました。 ベンチマーク結果の詳細はこちらをご覧ください。
|  |
価格
| 商品コード | 商品名 | 価格(税抜) |
|---|---|---|
| MD5600R-3.06-96GB | MD計算用計算機 MD5600R-3.06-96GB |  |
